潜伏期

潜伏期通常为1-2月，但时间变化大，在记录中曾出现4天到6年。此时病毒在伤口处肌肉内繁殖，时间视其肌肉与中枢神经的距离，以及病毒的感染量、视伤口溃烂程度、免疫力等因素而定。潜伏期中感染者没有任何症状，也不具传染性。在此阶段的治疗最有效，可以透过注射疫苗来治疗。

初期（可持续2至10日）

大多数患者出现非专一性的症状，包括全身不适、发烧、疲倦乏力、不安、恶心、食欲不振等，对疼痛、声音、光线等等外界刺激敏感，咽喉出现紧缩感。由于病毒在伤口附近大量繁殖而造成周围神经刺激，因而感到伤口附近有麻木、发痒、刺痛或虫类爬行的感觉。此阶段是病毒从周边神经转移至中枢神经的过渡期。

中期（痉挛期，约持续1至3日）

此时病毒在中枢神经内大量繁殖，造成破坏，已经没有治疗的可能。原先各种症状转趋强烈、明显，且出现严重痉挛。患者开始精神错乱而出现幻觉、谵妄、幻听等等症状，同时对于光、声音、水、风等外界刺激的反应变得更加激烈，其中对水的反应最剧烈。因迷走神经核、舌咽神经核及舌下神经核受损，引起呼吸道的保护性反射，呼吸肌、吞咽肌痉挛而出现恐水、吞咽及呼吸困难等症状，并可能持续5分钟。

尤其恐水是至多80%的患者都会出现的症状（个别患者恐水症状并不典型，亦不一定在早期出现），该表现为确认罹患狂犬病与否的重要症状之一，因该症状除狂犬病外尚未在其他疾病中出现。此“恐水”表现相当多元，举凡“喝水”、“流水声”、“看见水”可能导致咽喉肌严重痉挛，此时患者常常因喉部严重痉挛而窒息死亡。

由于脑部已受侵袭，各项认知功能开始退化，加上咽喉疼痛肿胀而缺氧，脸部会出现扭曲表情并烦躁不安，会突然出现冲动的失控场面如发狂大吼、自残等行为，此外还会因持续高烧而大量出汗导致脱水。部分病情较轻的病患此时期尚有部分言语、自主能力，但意识已不甚清楚。而大部分病患在此时期因高烧与神经破坏，随时可能死于中枢神经衰竭、呼吸衰竭、心脏衰竭或高血压、大型中风。

末期（瘫痪期，持续6至18小时）

随痉挛抽搐逐渐停止，病情进入末期。此时患者似乎逐渐趋于安静，少数病人病情出现短暂好转且恢复意识，能配合治疗、简单回答问话、或勉强饮水与进食。疾病似有好转，但意识将很快再陷入模糊，各种瘫痪症状逐步出现，尤以肢体瘫软为大宗，另外包括“颜面瘫痪”、“腹壁反射、提睾反射、膝跃反射”等生理反射消失的症状也会出现。

此时病患迅速陷入昏迷，呼吸逐渐减弱、不规则，出现大量“痰音”。脉搏逐步减弱、不规则，甚至无法测得。心跳减缓、心率混乱且血压逐步下降。皮肤失去血色转为湿冷并出现花纹且指端青灰。

病患最终瞳孔散大，口鼻腔中流出咖啡色液体，迅速死于呼吸、循环和全身衰竭。末期进程极快，不到一天即可能造成病患死亡。